Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms