Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms