Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 TOM70YNL121C 1854 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 ECM21YBL101C 3354 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 SPT2YER161C 1002 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YJL175WYJL175W 513 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YPR053CYPR053C 456 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 NSA1YGL111W 1392 nt2.84□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 CIN1YOR349W 3045 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YOR365CYOR365C 2112 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 HRD1YOL013C 1656 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YCR015CYCR015C 954 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YDR209CYDR209C 414 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 NKP1YDR383C 717 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 GPP2YER062C 753 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 SAY1YGR263C 1275 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 RPL6AYML073C 531 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YBL096CYBL096C 309 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YPR027CYPR027C 834 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 PBI1YPL272C 1554 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 ADH4YGL256W 1149 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 CSM3YMR048W 954 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 COS1YNL336W 1146 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YPR078CYPR078C 1119 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 STE24YJR117W 1362 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 SWC4YGR002C 1431 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 PLM2YDR501W 1566 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MSH2YOL090W 2895 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 REG1YDR028C 3045 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YNR063WYNR063W 1824 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MET5YJR137C 4329 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MON1YGL124C 1935 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 GYP7YDL234C 2241 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YCR085WYCR085W 354 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 CGR1YGL029W 363 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YHL045WYHL045W 348 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YIL174WYIL174W 228 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 AIM26YKL037W 357 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YKR011CYKR011C 1062 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 NIT3YLR351C 876 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YMR310CYMR310C 954 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 ATP11YNL315C 957 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MDJ2YNL328C 441 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 PIN3YPR154W 648 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 ADY4YLR227C 1482 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 HEH2YDR458C 1992 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 NTO1YPR031W 2247 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 SKT5YBL061C 2091 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 BEM4YPL161C 1902 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 ERP3YDL018C 678 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 IZH1YDR492W 951 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 SMT3YDR510W 306 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 DDI2YFL061W 678 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 RPS22AYJL190C 393 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MAK16YAL025C 921 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 ENV10YLR065C 546 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MCA1YOR197W 1299 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 LCL1YPL056C 306 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 AFT2YPL202C 1251 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 CDC55YGL190C 1581 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MRS2YOR334W 1413 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MSS4YDR208W 2340 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 PMI40YER003C 1290 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 PPX1YHR201C 1194 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 EMC2YJR088C 879 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 RSM26YJR101W 801 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 NDL1YLR254C 570 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 AAR2YBL074C 1068 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YOL024WYOL024W 519 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 HNT3YOR258W 654 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MUM2YBR057C 1101 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 POS5YPL188W 1245 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 EBS1YDR206W 2655 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YIL169CYIL169C 2988 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 BSC1YDL037C 987 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 YDL241WYDL241W 372 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 RMD5YDR255C 1266 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 VPS3YDR495C 3036 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG17Q06410 MIP6YHR015W 1980 nt2.78□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 CIK1YMR198W 1785 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 KIN3YAR018C 1308 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 ESL2YKR096W 3588 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 YDR290WYDR290W 330 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 PAN5YHR063C 1140 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 SYS1YJL004C 612 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 DID4YKL002W 699 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 AAH1YNL141W 1044 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 YPL035CYPL035C 348 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG17Q06410 GPI2YPL076W 843 nt2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms