Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms