Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALD1Q05682 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms