Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms