Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms