Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms