Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAP1Q01518 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms