Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms