Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEX3Q00994 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEX3Q00994 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms