Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDM2Q00987 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms