Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2BQ00403 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms