Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD1P98174 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD1P98174 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD1P98174 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD1P98174 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD1P98174 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms