Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKD1P98161 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKD1P98161 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKD1P98161 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKD1P98161 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PKD1P98161 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKD1P98161 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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