Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMF1P82094 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMF1P82094 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMF1P82094 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMF1P82094 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMF1P82094 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMF1P82094 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMF1P82094 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMF1P82094 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TMF1P82094 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMF1P82094 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms