Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms