Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTHL1P78549 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTHL1P78549 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms