Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2BP78356 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2BP78356 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms