Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NOMO3P69849 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms