Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM4P67936 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM4P67936 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM4P67936 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM4P67936 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPM4P67936 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM4P67936 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM4P67936 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms