Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP1P63208 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKP1P63208 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKP1P63208 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms