Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms