Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPNP63162 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms