Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113P63132 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms