Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRA2BP62995 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRA2BP62995 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms