Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL11P62913 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL11P62913 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms