Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2MP61081 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2MP61081 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms