Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA9P57773 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA9P57773 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA9P57773 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms