Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms