Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK1P57059 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK1P57059 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK1P57059 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK1P57059 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK1P57059 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK1P57059 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK1P57059 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK1P57059 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK1P57059 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK1P57059 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK1P57059 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms