Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME5P56597 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME5P56597 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME5P56597 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME5P56597 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME5P56597 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME5P56597 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME5P56597 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME5P56597 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms