Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCGRTP55899 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCGRTP55899 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms