Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHB4P54760 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms