Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CRISP3P54108 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CRISP3P54108 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CRISP3P54108 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms