Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMTNP53814 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMTNP53814 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMTNP53814 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNP53814 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNP53814 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms