Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBX1P52954 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBX1P52954 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBX1P52954 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBX1P52954 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBX1P52954 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX1P52954 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBX1P52954 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX1P52954 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms