Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LUMP51884 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LUMP51884 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LUMP51884 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LUMP51884 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms