Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP153P49790 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP153P49790 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP153P49790 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP153P49790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP153P49790 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP153P49790 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP153P49790 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP153P49790 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP153P49790 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP153P49790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP153P49790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP153P49790 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP153P49790 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP153P49790 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP153P49790 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP153P49790 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP153P49790 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP153P49790 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP153P49790 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP153P49790 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP153P49790 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP153P49790 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP153P49790 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NUP153P49790 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms