Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms