Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms