Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALR1P47211 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALR1P47211 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALR1P47211 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALR1P47211 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALR1P47211 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALR1P47211 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GALR1P47211 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GALR1P47211 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GALR1P47211 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms