Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms