Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DCCP43146 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DCCP43146 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DCCP43146 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DCCP43146 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DCCP43146 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DCCP43146 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DCCP43146 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DCCP43146 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DCCP43146 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DCCP43146 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DCCP43146 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DCCP43146 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DCCP43146 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCCP43146 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCCP43146 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCCP43146 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCCP43146 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCCP43146 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCCP43146 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCCP43146 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCCP43146 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCCP43146 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCCP43146 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms