Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A1P43005 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms