Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX3P40426 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PBX3P40426 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX3P40426 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX3P40426 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX3P40426 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX3P40426 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX3P40426 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms