Protein–RNA interactions for Protein: P40005

GIM4, Prefoldin subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM4P40005 RPL17BYJL177W 555 nt2.65□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YLR339CYLR339C 552 nt2.65□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SWP1YMR149W 861 nt2.65□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt2.65□□□□□ -1.99
GIM4P40005 HRD1YOL013C 1656 nt2.65□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MET5YJR137C 4329 nt2.65□□□□□ -1.99
GIM4P40005 CEP3YMR168C 1827 nt2.64□□□□□ -1.99
GIM4P40005 HPA3YEL066W 540 nt2.64□□□□□ -1.99
GIM4P40005 GPP2YER062C 753 nt2.64□□□□□ -1.99
GIM4P40005 PET130YJL023C 1044 nt2.64□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SEC7YDR170C 6030 nt2.64□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YLR278CYLR278C 4026 nt2.64□□□□□ -1.99
GIM4P40005 CWC22YGR278W 1734 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 COS7YDL248W 1152 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 TGL2YDR058C 981 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 RRT13YER066W 558 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 KXD1YGL079W 657 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YIR043CYIR043C 693 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MRPL49YJL096W 486 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 COS5YJR161C 1152 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YLR462WYLR462W 609 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 PPA2YMR267W 933 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MPD2YOL088C 834 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 PSY2YNL201C 2577 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 NET1YJL076W 3570 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 UBP14YBR058C 2346 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 ICR1ICR1 3199 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YDR239CYDR239C 2364 nt2.63□□□□□ -1.99
GIM4P40005 DIA2YOR080W 2199 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 RIM1YCR028C-A 408 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YKR047WYKR047W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 ERD2YBL040C 660 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YPL276WYPL276W 438 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MEF1YLR069C 2286 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 HBT1YDL223C 3141 nt2.62□□□□□ -1.99
GIM4P40005 DNA2YHR164C 4569 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 FLO11YIR019C 4104 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YPL150WYPL150W 2706 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 ISW1YBR245C 3390 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 snR70snR70 164 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 TIS11YLR136C 858 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YAR069CYAR069C 294 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 CDA2YLR308W 939 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YLR326WYLR326W 723 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YNL109WYNL109W 546 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YOL079WYOL079W 399 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MCM16YPR046W 546 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SLP1YOR154W 1764 nt2.61□□□□□ -1.99
GIM4P40005 CYR1YJL005W 6081 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MED1YPR070W 1701 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 ATG13YPR185W 2217 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MMS1YPR164W 4224 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SPT15YER148W 723 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 JIP3YLR331C 378 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MRPL33YMR286W 261 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 RSM19YNR037C 276 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MET6YER091C 2304 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 YFL040WYFL040W 1623 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 MTL1YGR023W 1656 nt2.6□□□□□ -1.99
GIM4P40005 BCK1YJL095W 4437 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 FKS3YMR306W 5358 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 TFC4YGR047C 3078 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SNL1YIL016W 480 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 ATP12YJL180C 978 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SED5YLR026C 1023 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 SIC1YLR079W 855 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 INP1YMR204C 1263 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 LCL1YPL056C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
GIM4P40005 WHI4YDL224C 1950 nt2.59□□□□□ -2
GIM4P40005 YIG1YPL201C 1386 nt2.59□□□□□ -2
GIM4P40005 YGR067CYGR067C 2415 nt2.59□□□□□ -2
GIM4P40005 RIX1YHR197W 2292 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 YPP1YGR198W 2454 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 RRP8YDR083W 1179 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 SMT3YDR510W 306 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 HYP2YEL034W 474 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 TAM41YGR046W 1158 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 AAH1YNL141W 1044 nt2.58□□□□□ -2
GIM4P40005 SGM1YJR134C 2124 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 BUR6YER159C 429 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 EFG1YGR271C-A 702 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 AIM39YOL053W 1188 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 FBP26YJL155C 1359 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 YDR132CYDR132C 1488 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 RGR1YLR071C 3249 nt2.57□□□□□ -2
GIM4P40005 ARC15YIL062C 465 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 YIL174WYIL174W 228 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 USV1YPL230W 1176 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 ACM1YPL267W 630 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 RPO41YFL036W 4056 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 SIR3YLR442C 2937 nt2.56□□□□□ -2
GIM4P40005 BUB1YGR188C 3066 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms