Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK1P39086 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms