Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGCXP38435 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGCXP38435 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGCXP38435 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGCXP38435 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms