Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZEB1P37275 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZEB1P37275 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms